דגן נולד באוקראינה, עלה לארץ בגיל 5 וגר עם משפחתו במעברת "מחנה ישראל" ליד לוד. לאחר מכן השתקעה המשפחה בבת ים. בהמשך דגן נישא לבינה, ולהם 3 ילדים.
דרכו הצבאית של דגן החלה בשנת 1963 בחטיבת הצנחנים, בשנת 1970 הקים את סיירת "רימון" וכיהן בתפקידי מפתח שונים, ביניהם שימש כיועץ לרמטכ"ל לענייני טרור, ראש חטיבת מבצעים במטכ"ל ואף זכה בעיטור העוז.
בשנת 2012, אובחן כחולה במחלת הסרטן ועבר השתלת כבד בבלארוס שהצילה את חייו. בתקופה האחרונה חלה התדרדרות במצבו הבריאותי שהובילה אל מותו המצער.
ראש הממשלה בנימין נתניהו, הביע צער על מותו של דגן. אנו משתתפים בצער המשפחה, על אדם שתרם רבות למדינת ישראל, שהקדיש את חייו לחיזוק ביטחון המדינה, הערכים, האידיאולוגיה, ועל פעילותו רבת השנים. יהי זכרו ברוך.